MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Alistipes shahii WAL 8301 draft genome

Total Repeats: 23269

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_021030	CCG	2	6	1380558	1380563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8502	NC_021030	GCCCG	2	10	1380624	1380633	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
8503	NC_021030	CGG	2	6	1380650	1380655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8504	NC_021030	CGG	2	6	1380666	1380671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8505	NC_021030	CGG	2	6	1380790	1380795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8506	NC_021030	CGT	2	6	1380921	1380926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8507	NC_021030	GA	3	6	1380937	1380942	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8508	NC_021030	CGT	2	6	1380976	1380981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8509	NC_021030	GGT	2	6	1381005	1381010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8510	NC_021030	TCG	2	6	1381064	1381069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8511	NC_021030	GTT	2	6	1381153	1381158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8512	NC_021030	GACG	2	8	1381206	1381213	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8513	NC_021030	CGCC	2	8	1381239	1381246	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8514	NC_021030	GCC	2	6	1381267	1381272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8515	NC_021030	TGA	2	6	1381296	1381301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8516	NC_021030	GTC	2	6	1381345	1381350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8517	NC_021030	TAC	2	6	1381408	1381413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8518	NC_021030	CAG	2	6	1381510	1381515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8519	NC_021030	AG	3	6	1381528	1381533	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8520	NC_021030	CGG	2	6	1381551	1381556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8521	NC_021030	ACG	2	6	1381566	1381571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8522	NC_021030	CCCGGC	2	12	1381582	1381593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8523	NC_021030	CCG	2	6	1381609	1381614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8524	NC_021030	ACG	2	6	1381619	1381624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8525	NC_021030	GCAC	2	8	1381652	1381659	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8526	NC_021030	CGG	2	6	1381666	1381671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8527	NC_021030	GCA	2	6	1381752	1381757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8528	NC_021030	GTCT	2	8	1381795	1381802	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8529	NC_021030	AGA	2	6	1382022	1382027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8530	NC_021030	GCT	2	6	1382042	1382047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8531	NC_021030	GTC	2	6	1382054	1382059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8532	NC_021030	CAGA	2	8	1382108	1382115	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8533	NC_021030	CGCTC	2	10	1382290	1382299	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
8534	NC_021030	TCT	2	6	1382388	1382393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8535	NC_021030	CAG	2	6	1383223	1383228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8536	NC_021030	GTT	2	6	1383325	1383330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8537	NC_021030	GAT	2	6	1383394	1383399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8538	NC_021030	GAA	2	6	1383439	1383444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8539	NC_021030	CGAA	2	8	1383522	1383529	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8540	NC_021030	TCGT	2	8	1383614	1383621	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8541	NC_021030	TGAA	2	8	1383704	1383711	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8542	NC_021030	TCC	2	6	1383721	1383726	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8543	NC_021030	TCA	2	6	1383880	1383885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8544	NC_021030	CAA	2	6	1383896	1383901	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8545	NC_021030	AT	3	6	1383915	1383920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8546	NC_021030	ATA	2	6	1383946	1383951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8547	NC_021030	T	6	6	1383968	1383973	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8548	NC_021030	AAAT	2	8	1383991	1383998	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8549	NC_021030	T	6	6	1384021	1384026	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8550	NC_021030	ATT	2	6	1384065	1384070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8551	NC_021030	TCT	2	6	1384125	1384130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8552	NC_021030	CAT	2	6	1384148	1384153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8553	NC_021030	GAA	2	6	1384189	1384194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8554	NC_021030	ATT	2	6	1384277	1384282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8555	NC_021030	ACT	2	6	1384346	1384351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8556	NC_021030	TTG	2	6	1384353	1384358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8557	NC_021030	TTTC	2	8	1384399	1384406	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8558	NC_021030	TA	3	6	1384429	1384434	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8559	NC_021030	TA	3	6	1384438	1384443	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8560	NC_021030	AAT	2	6	1384491	1384496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8561	NC_021030	AT	3	6	1384495	1384500	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8562	NC_021030	ATTC	2	8	1384567	1384574	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8563	NC_021030	AAT	2	6	1384631	1384636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8564	NC_021030	TTA	2	6	1384666	1384671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8565	NC_021030	TA	3	6	1384727	1384732	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8566	NC_021030	TGTTC	2	10	1384741	1384750	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
8567	NC_021030	AAT	2	6	1384781	1384786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8568	NC_021030	TTG	2	6	1384828	1384833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8569	NC_021030	ATG	2	6	1384864	1384869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8570	NC_021030	TCT	2	6	1384981	1384986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8571	NC_021030	T	6	6	1384991	1384996	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8572	NC_021030	ATC	2	6	1384997	1385002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8573	NC_021030	AAAT	2	8	1385005	1385012	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8574	NC_021030	AT	3	6	1385064	1385069	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8575	NC_021030	TCT	2	6	1385094	1385099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8576	NC_021030	GTA	2	6	1385171	1385176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8577	NC_021030	TA	3	6	1385186	1385191	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8578	NC_021030	ATA	2	6	1385199	1385204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8579	NC_021030	CGC	2	6	1385207	1385212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8580	NC_021030	CGC	2	6	1385249	1385254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8581	NC_021030	AT	3	6	1385297	1385302	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8582	NC_021030	CGAAG	2	10	1385320	1385329	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
8583	NC_021030	CAT	2	6	1385335	1385340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8585	NC_021030	TCA	2	6	1385388	1385393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8586	NC_021030	TAA	2	6	1385420	1385425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8587	NC_021030	ATA	2	6	1385506	1385511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8588	NC_021030	T	6	6	1385567	1385572	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8589	NC_021030	T	6	6	1385578	1385583	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8590	NC_021030	ATT	2	6	1385786	1385791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8591	NC_021030	CAA	2	6	1385798	1385803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8592	NC_021030	TGA	2	6	1385920	1385925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8593	NC_021030	TGA	2	6	1385972	1385977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8594	NC_021030	T	7	7	1386053	1386059	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8595	NC_021030	TTA	2	6	1386102	1386107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8596	NC_021030	GTA	2	6	1386197	1386202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8597	NC_021030	AGA	2	6	1386254	1386259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8598	NC_021030	ATA	2	6	1386265	1386270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8599	NC_021030	TTC	2	6	1386317	1386322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8600	NC_021030	AAT	2	6	1386398	1386403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8601	NC_021030	GCA	2	6	1388396	1388401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8602	NC_021030	GTTC	2	8	1388485	1388492	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8603	NC_021030	T	7	7	1388508	1388514	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8604	NC_021030	A	6	6	1388529	1388534	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8605	NC_021030	T	6	6	1388627	1388632	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8606	NC_021030	A	8	8	1388634	1388641	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8607	NC_021030	GA	3	6	1390467	1390472	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8608	NC_021030	GCG	2	6	1390501	1390506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8609	NC_021030	GCA	2	6	1392009	1392014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8610	NC_021030	CGA	2	6	1392030	1392035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8611	NC_021030	GTT	2	6	1392048	1392053	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8612	NC_021030	GT	3	6	1392119	1392124	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8613	NC_021030	ACG	2	6	1392224	1392229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8614	NC_021030	CCG	2	6	1392459	1392464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8615	NC_021030	CGC	2	6	1392465	1392470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8616	NC_021030	CGG	2	6	1392477	1392482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8617	NC_021030	CGG	2	6	1392489	1392494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8618	NC_021030	GC	3	6	1392577	1392582	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8619	NC_021030	CGG	2	6	1392594	1392599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8620	NC_021030	TGT	2	6	1392641	1392646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8621	NC_021030	GCC	2	6	1392708	1392713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8622	NC_021030	CGGATA	2	12	1392818	1392829	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8623	NC_021030	ATT	2	6	1392988	1392993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8624	NC_021030	A	6	6	1394901	1394906	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8625	NC_021030	TAC	2	6	1394931	1394936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8626	NC_021030	GAC	2	6	1394947	1394952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8627	NC_021030	AGC	2	6	1394959	1394964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8628	NC_021030	GA	3	6	1394992	1394997	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8629	NC_021030	A	6	6	1395015	1395020	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8630	NC_021030	ATC	2	6	1395025	1395030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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